1、接种脊髓灰质炎疫苗后孩子会瘫痪
事实上，这种说法在以前是真实的。过去那种口服脊髓灰质炎疫苗现在已经不用了，之前，这种老式疫苗每年会让1-2个婴儿瘫痪。因为这个原因，现在改用了注射型脊髓灰质炎疫苗，不会有副作用。
2、DTP疫苗的百日咳疫苗会引起脑损伤
关于该疫苗的百日咳疫苗，坊间流传着很多错误信息。这些糟糕的印象是来自现在已不再使用的旧的“全细胞”百日咳疫苗。这种旧疫苗引起的严重反应要比其他疫苗高很多。这种旧疫苗有可能导致脑炎和突然休克。有少数儿童因此变得残废。虽然没有证据能证明是疫苗导致了这些严重的后果，但医疗界对此很怀疑。因此推出了新的非细胞形式的百日咳DTaP疫苗。百日咳细胞反应最积极的部分已经被这种疫苗去除。因接种新疫苗而产生严重反应的例子极少，大部分婴儿都不会产生副作用。
有些国家竟因为公众恐惧而停止使用DTP或DTaP疫苗，结果百日咳很快就卷土重来，幼儿死亡率上升，这使得他们不得不重新启用这种疫苗。
3、接种会导致自闭症
这种争议主要针对MMR这种疫苗。一位伦敦的研究者发现，很多自闭症儿童肠道里都存在麻疹病毒。他推测说这可能来自疫苗，是对自闭症产生很大作用的因素。另外，最近几十年自闭症儿童数量增多，时间与某些疫苗的启用恰好同步。医学专家对这些问题进行了研究，并没有发现能证明麻疹病毒会导致自闭症的证据。有很多因素会导致自闭症，包括遗传、环境污染和营养等。
4、疫苗并不总是起作用
这种说法的确是真的。但是，从没有人声称疫苗永远有效。大部分疫苗能提供80%一95%的保护。这意味着，如果个注射过疫苗的人处在会感染疾病的环境中，有5-20个人会感染。这比所有人都感染已经好很多了。这种高比例的保护确保某些疾病在人群中不会大范围扩散。另外，如果接种过疫苗的儿童感染了某种疾病，比起没有接种过的儿童，病情会轻微很多。
5、疫苗中包含汞
在年9月之前，这种说法是正确的，那时一种新合成的联合疫苗DTaP/IPV/Hib正投入使用。美国药物安全委员会（CSM）发现，且然极少的一点汞在疫苗中是无害的，但各种疫苗累积起来的汞含量对一两岁的婴儿来说就太多了。媒体对此大加报道，引起了群众恐慌，促使疫苗生产商在几乎所有的疫苗中去除了汞的成分。
6、疫苗的风险和益处
每一种疫苗——准确地说每一种外来物质（甚至一种新食品）——进人宝宝的身体当中，都既有风险，也有益处。衡量任何一种药物或疫苗，我们的标准是：益处大过风险。
几乎所有的疫苗都是低风险、高回报。有几种疫苗不再使用，就是因为其益处并不大过风险，它们现在有了更安全的替代品。有一个特例是天花疫苗，因为天花这种病已经完全绝迹，而疫苗本身会导致一些严重的疾病，所以人们不再接种天花疫苗。
目前实行的疫苗接种时间表带来的风险很少。预防潜在致命疾病的益处，远远大过疫苗带来的小风险。
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